Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clec4a4Q5YIR8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms