Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brip1Q5SXJ3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brip1Q5SXJ3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms