Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme4Q5SSW2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms