Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps41Q5KU39 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps41Q5KU39 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms