Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf608Q56A10 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms