Protein–RNA interactions for Protein: Q56A08

Gpkow, G-patch domain and KOW motifs-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpkowQ56A08 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpkowQ56A08 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms