Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn2bQ56A07 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn2bQ56A07 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Scn2bQ56A07 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Scn2bQ56A07 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Scn2bQ56A07 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Scn2bQ56A07 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Scn2bQ56A07 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2bQ56A07 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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