Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2al1nQ497L1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms