Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skap1Q3UUV5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms