Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec31aQ3UPL0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec31aQ3UPL0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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