Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rmi2Q3UPE3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rmi2Q3UPE3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms