Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nlrc4Q3UP24 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrc4Q3UP24 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms