Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Skap2Q3UND0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms