Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem253Q3UNB8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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