Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rmdn3Q3UJU9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rmdn3Q3UJU9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms