Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Cops9Q3U898 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Cops9Q3U898 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Cops9Q3U898 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cops9Q3U898 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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