Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRG0

Gm1604b, Gene model 1604B, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1604bQ3TRG0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm1604bQ3TRG0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm1604bQ3TRG0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms