Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarca4Q3TKT4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca4Q3TKT4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms