Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1aQ2LKU9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms