Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cers3Q1A3B0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms