Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC21.27■■□□□ 1
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Tdrd9Q14BI7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd9Q14BI7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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Tdrd9Q14BI7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd9Q14BI7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Tdrd9Q14BI7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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Tdrd9Q14BI7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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