Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp2b3Q0VF55 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp2b3Q0VF55 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms