Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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