Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubxn2bQ0KL01 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubxn2bQ0KL01 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms