Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cass4Q08EC4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms