Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MitfQ08874 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms