Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AmbpQ07456 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AmbpQ07456 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms