Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Prrx2Q06348 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms