Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pfdn6Q03958 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms