Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Crisp3Q03402 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms