Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddr1Q03146 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms