Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GscQ02591 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GscQ02591 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GscQ02591 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GscQ02591 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GscQ02591 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GscQ02591 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GscQ02591 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GscQ02591 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GscQ02591 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GscQ02591 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GscQ02591 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GscQ02591 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms