Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms