Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grin2bQ01097 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grin2bQ01097 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms