Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfaQ00731 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms