Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme1P97371 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms