Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vgll3P85442 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vgll3P85442 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vgll3P85442 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vgll3P85442 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vgll3P85442 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms