Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chl1P70232 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chl1P70232 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chl1P70232 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms