Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dpf3P58269 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpf3P58269 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms