Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CdaP56389 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CdaP56389 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CdaP56389 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CdaP56389 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CdaP56389 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CdaP56389 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CdaP56389 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CdaP56389 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CdaP56389 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CdaP56389 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CdaP56389 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CdaP56389 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CdaP56389 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CdaP56389 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CdaP56389 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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