Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux1P53564 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux1P53564 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cux1P53564 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cux1P53564 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms