Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FmodP50608 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FmodP50608 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
FmodP50608 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
FmodP50608 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
FmodP50608 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
FmodP50608 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
FmodP50608 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FmodP50608 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms