Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmod1P49813 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms