Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcd1P48410 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcd1P48410 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms