Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VdrP48281 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VdrP48281 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VdrP48281 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VdrP48281 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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