Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Flt1P35969 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Flt1P35969 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms