Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprkP35822 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprkP35822 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprkP35822 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprkP35822 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms