Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin1P35438 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grin1P35438 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms