Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PdgfraP26618 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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