Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CftrP26361 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CftrP26361 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CftrP26361 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CftrP26361 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CftrP26361 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CftrP26361 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CftrP26361 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CftrP26361 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CftrP26361 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms